生物學家通過精巧的基因電路設計和火力全開的免疫因子,避開健康細胞成功識別并殺滅了實驗小鼠體內的癌細胞,將癌細胞的偽裝、應激、抵抗一一化解?!都毎冯s志近期刊登的這個研究有哪些獨到之處?
基因電路?活體里的電子學科嗎?難不成是研究人類機器人?
且慢,別急著思考倫理問題,這種提法其實是生物學家強大的想象,指的是利用合成生物學的精巧設計,控制細胞里的通路,讓人們能“開關”細胞的行動。
近日,《細胞》雜志刊登美國麻省理工學院盧冠達團隊的研究成果,他們設計了基于合成RNA的免疫調節(jié)基因電路、可用于癌癥的免疫治療。
這款“精妙”的基因電路如何工作?它又如何制服狡猾、善變的癌細胞呢?科技日報記者日前專訪了兩位“千人計劃”專家,分別解答該研究中兩個科學領域的問題。
造個“特洛伊木馬”,幫“信號兵”潛進癌細胞的城池
弄清科學家的精妙設計,還要從它的攻擊對象——癌細胞說起。
眾所周知,癌細胞無限繁殖,這個特點只有它“扎堆”的時候才能顯現(xiàn)出來。機體要殺滅單個細胞,如何區(qū)分癌細胞和正常細胞呢?
“癌細胞內部是特異性表達,”“青年千人計劃”學者、四川大學生物治療國家重點實驗室羅云孜說,“癌基因、原癌基因等會在癌細胞中被激活,使正常細胞發(fā)生癌變。這個研究中用的是cMYC、E2F1(基因名)兩個轉錄因子基因。”
也就是說這兩個基因在癌細胞中異常活躍,而正常細胞中它們相對平靜。盧冠達團隊將它們看成癌細胞自帶的“鑰匙”,根據(jù)鑰匙設計了一套“鎖”。鎖的特點是,只有兩個鑰匙同時開鎖,才會被打開。
羅云孜解釋,第一把鑰匙打開的反應不會進行到底,“第一個啟動子啟動轉錄,生成的mRNA(信使RNA)會在尾部有個特別的結構,能和細胞內的微小RNA結合(miR1),不會繼續(xù)進行蛋白翻譯的步驟。只有當?shù)诙€啟動子啟動的轉錄生成了另一段序列,走過來把miR1帶走,蛋白翻譯才會繼續(xù)進行”。
這種兩把鑰匙合作開一把鎖的模式,在集成電路中被稱為“與門”結構。盧冠達表示,是受“與門”的啟發(fā),想到設計這個結構的。
把合成的基因電路“安插”進癌細胞中,團隊利用了慢病毒載體。“病毒侵染,可以讓病毒的每一代都有特異表達”,“千人計劃”創(chuàng)業(yè)人才、上海比昂生物創(chuàng)始人楊光華說,總的來說,這套裝置就像特洛伊木馬,將信號兵帶進癌細胞的城池,而只有兩把鑰匙共同打開木馬上的鎖,信號兵才會出來發(fā)信號。
“這個設計雖然使用已知基因元件,但并不簡單,需要進行嚴格的篩選。導入基因必須和正常細胞內的系統(tǒng)沒有關聯(lián)性,確保只啟動癌細胞中的‘電路’,不會對正常細胞產生影響。”羅云孜說,研究團隊經過了大量的優(yōu)化實驗,才完成基因序列的最終合成。
基因電路最難做到的是“準確”。盧冠達團隊合成的精巧的控制器,為“攻擊手”辨認癌細胞設置了一個“雙保險”的開關。羅云孜說:“它起的是精確制導的靶子的作用,這項研究大大降低對正常細胞的誤傷率。”
在癌細胞里安插了準確的“信號兵”,下一步就可以進行“攻城拔寨”的戰(zhàn)斗了。也就是接入功能基因,開啟對癌細胞的“征討”。
煙霧彈、信號彈、照明彈、遠程長短炮……火力齊發(fā)
一旦信號兵放倒“消息樹”,身體內的免疫系統(tǒng)將會被調動起來。接下來的實戰(zhàn),是一場堪比《權利與游戲》的抗癌“心機戲”——
一頭,研究用基因電路的方法設計了能準確放倒“消息樹”的“信號兵”,另一頭,合成了完備的全功能攻擊戰(zhàn)斗團。
為啥這個戰(zhàn)斗團前要加上這么多修飾詞呢?因為目前很少有研究將多個不同角色的腫瘤對抗基因聯(lián)合起來編隊。
戰(zhàn)斗團編隊有4個,分別是表面T細胞結合子(STE),一種細胞表面抗原,是癌細胞的特異性識別位點;趨化因子21(CCL21),可以促進T細胞在癌細胞位點聚集;白介素12(IL12),一種可以增強T細胞活性和功能的細胞因子;PD-1抑制,能夠降低癌細胞對免疫系統(tǒng)的抑制。
“STE,它幫助能殺傷癌細胞的T細胞鎖定目標,有照明彈的功能,”楊光華一一解釋,“CCL21,像信號彈,所有的T細胞火力將循著身體里的這個信號向癌細胞集結;IL12是真正的炮彈,使得T細胞的火力和功能大大增強,具有高活力的殺傷性。”
其中最斗智的是“PD-1抑制”的設計,它專門針對癌細胞這個“戲精”。“癌細胞會‘扮演’成正常細胞。”楊光華說,“其表面出現(xiàn)PD-L1與T細胞表面的PD-1結合,會騙過T細胞,而PD-1抑制的‘元件’像‘煙霧彈’阻擋假象對T細胞的干擾。”
“癌細胞有應激反應,會越戰(zhàn)越精,所以4種不同方法并用,應對狡猾的癌細胞。”羅云孜說,希望能達到腫瘤完全消退的目的。
但是,在實際的臨床治療中,還需要更深入的開發(fā)。楊光華認為,研究用的材料是理想狀態(tài)的腫瘤細胞系,而實際的腫瘤細胞基因非常復雜,并不一定能強勁開啟對腫瘤細胞全方位的識別。“研究提出了一個治療新理念——免疫基因電路平臺的概念,能夠特異性表達這些免疫基因,達到篩選的目的。”
拼裝、運行、驗證,基因就像一個個小的“電子元器件”
今年3月,《科學》雜志刊出???,總結刊登了7篇合成生物學方面的重大突破,其中有4篇成果是中國學者作為通訊作者發(fā)表的。羅云孜說:“他們的工作主要是人工合成了酵母的基因組。”
“這在合成生物學領域是重大事件”,羅云孜說,這證明從2008年美國科學家合成支原體基因組以來,人類對基因組的合成已經上升到了真菌界,人類可以創(chuàng)造出真核生物。
“基因組的合成包含對基因功能的驗證、組合和優(yōu)化設計。”羅云孜說,其間,基因像一個個小的“電子元器件”,拼裝、運行、驗證,用于完成人們的生產生活目標。
在微生物制造方面,進行了基因電路改造的酵母已經可以用于人參有效物質的合成,例如皂苷等。羅云孜說:“合成植物來源化合物,需要多個基因組合表達,進行改變優(yōu)化的東西很多。如何有效表達,如何調配不同基因的表達量,都要精確的程序設置。”
“我們需要回答的問題是,不同的基因元件,如何搭起來更有效、更精準。”作為合成生物學家,羅云孜解釋,對于已知功能的基因,將其模塊化、基本化,用于進一步的裝配研究,“然而人類對基因的功能并不是完全清楚。相較于電子元器件來說,裝配基因會更不穩(wěn)定,需要設計復雜的實驗予以證實”。
在醫(yī)學研究方面,我國已經利用合成生物學建立起相關疾病的篩查和驗證平臺。此外為了增加基因療法的安全性,楊光華團隊還在進行藥物控制免疫系統(tǒng)對癌細胞攻擊的研究。
楊光華介紹,團隊此前構建了可誘導的慢病毒載體,可實現(xiàn)通過給藥、停藥開關基因表達,通過藥物劑量來控制CAR-T療效的強弱,從而調控體內免疫系統(tǒng)與癌細胞的“戰(zhàn)爭級別”。
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