隨著長征十一號運載火箭的一聲轟鳴,在地球上幾近消失的華南虎DNA(脫氧核糖核酸)被存儲在特制容器中向太空飛去。與華南虎DNA干粉同行的,還有金絲猴、天行長臂猿、蕙蘭、水稻、大豆、三七、蒲公英等動植物的基因樣本。
據(jù)報道,此前不久的2018年10月底,科幻作家劉慈欣等人的DNA樣本,通過長二丙火箭被運送至太空,期望實現(xiàn)在太空永久保存。DNA保存受哪些因素影響?為什么要進入太空才能永久保存?基因在太空保存萬年之后又有什么用?
水解酶、酸堿度、輻射,DNA有三大怕
低溫、真空是太空在物種保存方面的有利條件。“這都要從DNA的特性說起。”西安交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院特聘研究員、博士生導(dǎo)師張德文解釋,從生物化學(xué)的角度看,DNA是一個“珠鏈”狀的生物大分子化合物,每顆串在上面的“珠子”是核苷酸,串起的“線”是磷酸。DNA之所以存儲了生命的信息,在于核苷酸不同,即組成其的四個堿基A、T、C、G排列順序不同,這些堿基密碼就像文字一樣記錄可遺傳的信息。
“要想把信息經(jīng)過千萬年的時間也能傳下去,記錄的密碼就不能打散,變成單個字、打亂順序都不行。”張德文說,在地球上存在一種東西能讓DNA的“珠鏈”斷裂,而且?guī)缀鯚o處不在。
它就是DNA水解酶。DNA分子一碰到它,磷酸二酯鍵就被切斷了,就像鏈子斷裂,珠子會掉一地,能表達信息的順序也將不復(fù)存在。DNA水解酶都是來自生物體,伴隨著微生物而在地球上分布廣泛,因此常溫下DNA只能放置幾天。
除了獨特的酶這一生物“天敵”之外,DNA還有化學(xué)和物理上的弱點。
DNA對酸和堿都非常敏感。游離的金屬離子會讓DNA發(fā)生催化反應(yīng),最終變性,因此DNA的保存溶液都需要pH恒定或搖擺幅度不大。實驗室短期內(nèi)使用的DNA,需要放置在緩沖溶液中保存,“緩沖”指的就是這種溶液對決定酸堿度的離子能夠“包容”,離子多了就吸附,少了自己也可提供離子基團,保持住整個環(huán)境中的酸堿度,像一塊“海綿”,為DNA“減震”。
物理方面,太空輻射、紫外線中的高能粒子,能使DNA斷裂氧化。這就是為什么紫外線或核輻射會造成基因變異。高溫高壓環(huán)境也會對DNA的穩(wěn)定性產(chǎn)生影響。
“所以DNA理想的保存環(huán)境是:避開生物,低溫;避開光,黑暗;避開水,干燥。”張德文總結(jié)。
保存方式與保存時長密切相關(guān)
西伯利亞凍土層的猛犸象不僅DNA保存完好,部分組織也是完整的。而常溫DNA在溶液中保存的話,可能不到幾天就會裂解??梢姡4娣绞脚c保存時間長度密切相關(guān)。
將DNA在緩沖溶液中保存,4℃可以保質(zhì)幾天。-20℃可以保存幾周,這些在普通冰箱就可以實現(xiàn)。現(xiàn)在的實驗條件比之前大幅提高,很多實驗室都會有-80℃的冰箱,可保存幾個月。幾年的話,需要離開水環(huán)境,即不給水解酶發(fā)揮作用的環(huán)境,例如DNA干粉在液氮中保存。
然而超低溫冰箱和液氮的存儲都將耗費大量能源,有研究一直在摸索常溫下的DNA有效保存。有資料顯示,乙醇等可以有效減少DNA鏈的斷裂,DNA可在室溫下保存兩年后仍具有90%的原始螺旋結(jié)構(gòu)。通過固相吸附等技術(shù)也可實現(xiàn)在常溫下的多年保存,例如經(jīng)化學(xué)處理的纖維素基質(zhì)可使DNA免受核酸酶、氧化劑以及細菌等的危害,經(jīng)由該基質(zhì)保存22年的血液樣品也能夠在法醫(yī)遺傳學(xué)上完成STR(一種名叫“短串聯(lián)重復(fù)序列測定”的親子鑒定方法)實驗。
除了在溫度、溶劑、基質(zhì)上想辦法,科學(xué)家還嘗試在DNA的形態(tài)上發(fā)展出存儲好方法。與DNA溶液相比,固態(tài)的穩(wěn)定性更加優(yōu)良,乙醇沉淀、空氣干燥、凍干干燥均為DNA干燥方式。干燥處理不僅能降低DNA樣品中分子流動性,而且還極大地消除了DNA水解反應(yīng)。烘干、冷凍凍干機等干燥方式均可以有效減小DNA樣品中水分子,但是在干燥過程中所產(chǎn)生的剪切力也會對長鏈DNA分子造成一定破壞。
低溫凍存仍是目前DNA保存應(yīng)用最廣泛的方法。但是“有凍就有融”,融化取用過程中會對DNA的結(jié)構(gòu)和信息有哪些影響呢?
國外有學(xué)者以小牛胸腺DNA進行研究,發(fā)現(xiàn)反復(fù)凍融后其雙螺旋結(jié)構(gòu)已經(jīng)發(fā)生了改變,相關(guān)低溫水解的機理顯示,DNA樣品的冰凍速率以及凍存溫度會影響DNA降解。低溫水解會促使DNA樣品內(nèi)產(chǎn)生冰內(nèi)裂縫。有研究表明,糖類物質(zhì)能夠有效減少DNA嵌入在玻璃體時的開裂。
自然界總是給科學(xué)家欣喜。英國牛津大學(xué)曾對西伯利亞和新西蘭采集的土壤標(biāo)本進行研究時發(fā)現(xiàn),DNA可以在土壤中保存40萬年。他們對土壤樣本中發(fā)現(xiàn)的古代猛犸和恐鳥的DNA進行分析后證實,DNA自然保存的時間遠比人們想象的要長,到目前為止,科學(xué)家對早期生物的研究主要還是依賴保留在巖石和土壤中的化石,這一發(fā)現(xiàn)啟發(fā)史前研究者,在化石之外還可以試試DNA。
在太空期待與外星人“偶遇”
“進入太空永久保存,在時間概念上是超越人類發(fā)展歷史的,以上萬年為單位,因此才會稱為‘永久’。”張德文提醒,這個時間長度甚至比以文字形態(tài),或電子信號形態(tài)存儲的時間都要久。
穿越千萬年需要哪些保障呢?資料顯示,基因樣本由中國國家基因庫完成采樣和穩(wěn)定化處理。這里提到的穩(wěn)定化處理,包括溶劑處理、干燥處理等。
資料顯示,裝載DNA的容器是擁有知識產(chǎn)權(quán)的特別研制的太空基因容器,容器具有隔絕空間輻射等功能,可以實現(xiàn)生物基因的永久在軌保存。搭載該太空基因容器的科學(xué)實驗微小衛(wèi)星將記錄并回傳基因樣本在發(fā)射過程和軌道保存期間的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù),以驗證地球物種基因樣本太空保存的可行性和有效性。樣本目前并不考慮取回。
張德文認為,DNA的應(yīng)用將寄望于合成生物學(xué)的發(fā)展。目前,完全的人工合成生物還沒實現(xiàn),但從2002年有報道顯示,病毒基因組可以實現(xiàn)化學(xué)合成。2010年最簡單的單細胞生物體支原體的全基因組DNA合成完畢。2018年8月2日,《自然》在線發(fā)表我國科學(xué)家覃重軍研究團隊與合作者首次人工創(chuàng)建了單條染色體的真核細胞的成果,將單細胞真核生物——釀酒酵母天然的16條染色體人工創(chuàng)建為具有完整功能的單條染色體,酵母三分之一基因與人類同源。
目前的人工合成的遺傳物質(zhì),需替換到原有細胞中,全新的人造全基因組再發(fā)揮作用,開啟組裝新生命。DNA發(fā)揮作用的細胞環(huán)境還沒有實現(xiàn)人工生產(chǎn)。
“以后可能有用,前提是合成生物學(xué)中人工合成生命相關(guān)技術(shù)發(fā)展成熟。按照現(xiàn)在科技的發(fā)展速度也不好說,從合成生物學(xué)學(xué)科建立到現(xiàn)在還不到20年,已經(jīng)進展到單細胞真核生物染色體組的合成了,未來可能不斷加速。”張德文說。
關(guān)于太空永久保存DNA的再次啟用,有著更多的科幻色彩。如果人類滅絕了,或許會被外星人發(fā)現(xiàn),重新再造人類這個物種。未來需要想象。
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